福田口岸位于福田区裕亨路23号（福田保税区东侧）。总占地面积62962平方米，总建筑面积84198平方米。旅检大厅面积约12000平方米，二层为入境旅检大厅，三层为出境旅检大厅。
福田口岸设计日过境旅客通过能力为25万人次。设计通关时间为每日6：30时至24：00时。经深港双方商定，从2007年口岸开始运行起，通关时间暂定为每日6：30时至22：30时，运行16小时，与深圳地铁的运营时间相衔接。
福田口岸共有出入境旅客通道167条，其中出境人工通道30条，自助通道57条；入境人工通道28条，自助通道52条。

文锦渡口岸位于深圳市罗湖区南面、香港新界北面，由一座公路桥与香港新界相连。是以供港鲜活产品及进口水果通关为特点的客、货运综合性公路口岸。
文锦渡口岸是改革开放前深圳仅有的两个陆路口岸之一。2010年，文锦渡口岸开始进行旅检场地改造。2013年8月26日，文锦渡口岸客运区域改造完成并恢复运行。改造后，设计日过境旅客通过能力30000人次；日过境车辆通过能力10000辆次。
文锦渡口岸区域占地面积13.8万平方米。其中，出入境旅检场地3万平方米，出入境货物查验场地10万平方米（入境6万平方米，出境4万平方米）。共有28条车辆检查通道，其中，货车通道18条（入境10条，出境8条），小（客）车查验通道10条（出入境各5条，其中：小车通道3条、客车2条）。文锦渡口岸每日7时开闸，22时关闸，运行15小时。

罗湖口岸位于深圳罗湖商业中心区南侧，与香港新界一河之隔，深港两地由一座双层人行桥和一座铁路桥相连，是改革开放前深圳仅有的两个陆路口岸之一。
罗湖口岸现联检大楼于1984年1月开始动工兴建，1985年6月14日竣工启用。占地面积9106平方米，主楼高12层(含地下一层)，南、北附楼各3层，总建筑面积共70623平方米。
罗湖口岸出入境验证通道共有186条，其中人工查验通道81条，自助查验通道105条。口岸设计通过能力由上世纪八十年代每天20万人次，提高到2002年以来每天40万人次。罗湖口岸开放时间为每天6时开闸，24时关闸，运行17.5小时。